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Les nouvelles variantes de COVID19 ; Caractéristiques et préoccupations

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) est un type de coronavirus avec des pointes en forme de couronne à sa surface. Ce virus a été identifié comme l’agent causal de la COVID-19 (autrement appelée maladie COVID-19). Comme d’autres virus, le CoV-2 du SRAS a subi des modifications par le biais de mutations. Les mutations sont des changements dans le code génétique d’un virus qui se produisent naturellement au fil du temps lorsqu’un animal ou une personne est infecté, donnant naissance à de nouvelles variantes. Les variantes sont des virus dont la séquence génétique change à la suite d’une mutation [1]. Les recherches préliminaires indiquent que ces variantes se propagent plus facilement et plus rapidement que le virus original et que les anticorps générés par la vaccination avec les vaccins actuellement autorisés reconnaissent ces variantes [2]. Selon les analyses génétiques effectuées jusqu’à présent, de multiples variantes du virus ont été documentées dans le monde entier, dont certaines sont ;

  • B.1.1.7 qui a été identifié pour la première fois au Royaume-Uni et a été détecté dans différentes parties du globe. Cette variante est également appelée SRAS-CoV-2 COV 202012/01 (Variante préoccupante, année 2020, mois 12, variante 01) et son origine n’est pas encore certaine [3]. Les résultats épidémiologiques, de modélisation, phylogénétiques et cliniques préliminaires suggèrent que le COV 202012/01 du SRAS-CoV-2 a une transmissibilité accrue par rapport aux autres variantes existantes du virus (OMS 2020). Toutefois, les recherches sont toujours en cours pour confirmer ces résultats [2]. En décembre 2020, cette nouvelle variante avait été signalée dans 31 autres pays [3].
  • B.1.351 qui a été détecté en Afrique du Sud. L’Afrique du Sud a nommé cette variante 501Y.V2, en raison d’une mutation N501Y [3]. Elle a émergé indépendamment de B.1.1.7 mais partage certaines mutations avec elle. Selon les données génomiques, la variante 501.V2 a rapidement déplacé d’autres lignées circulant en Afrique du Sud, et les premières études indiquent que la variante est associé à une charge virale plus élevée, ce qui pourrait suggérer un potentiel de transmissibilité accrue, cependant, celles-ci sont encore sujettes à des recherches plus approfondies [3]. Tout comme pour la variante B.1.1.7, on ne sait pas encore si la nouvelle variante est associée à une maladie plus grave ou à des résultats plus défavorables. Elle a été détectée en octobre 2020 et des cas causés par cette variante ont été signalés aux États-Unis [2]. Elle a également été signalée au Zimbabwe et constitue maintenant plus de 60 % des cas à ses frontières. Elle a également été identifiée au Botswana, en Gambie, au Ghana et en Zambie [4].
  •  La variante P.1 a été identifiée pour la première fois chez des voyageurs en provenance du Brésil, qui ont été testés lors d’un dépistage de routine dans un aéroport au Japon, début janvier [5]. Cette variante contient un ensemble de mutations supplémentaires qui peuvent affecter sa capacité à être reconnue par des anticorps [2]. Toutefois, les recherches visant à confirmer ces allégations sont toujours en cours.
  • 20A.EU1, également connu sous le nom de “variante espagnole”. Cette version de COVID-19 a détecté une mutation sur sa protéine de spicule qui a été désignée A222V. On pense que la mutation de ce virus s’est produite en Europe lorsque les restrictions de voyage ont été assouplies pour les voyages de vacances.

La plupart ou la totalité de ces variantes ont été identifiées aux États-Unis et la variante du Royaume-Uni est soupçonnée de devenir dominante dans les jours à venir [6]. Certains experts ont indiqué qu’il y a une augmentation du nombre de cas dus à ces variantes chez les enfants [7], mais selon d’autres, les enfants sont infectés par les anciennes variantes de la même manière qu’il n’y a pas encore de preuves convaincantes [8]. Quoi qu’il en soit, la recherche sur ces revendications est toujours en cours.

En outre, la situation de ces nouvelles variantes et des vaccins déjà disponibles suscite également des inquiétudes, car certaines preuves préliminaires suggèrent que certaines réponses immunitaires induites par les vaccins actuels pourraient être moins efficaces contre certaines des nouvelles souches. Par exemple, un petit essai clinique sur le vaccin Oxford-AstraZeneca pourrait ne pas être efficace pour prévenir une maladie légère à modérée due à la variante de l’Afrique du Sud [9]. Selon le professeur Gupta, les vaccins entraînent le système immunitaire à attaquer plusieurs parties différentes du virus, de sorte que même si une partie du pic a muté, les vaccins devraient encore fonctionner. Cependant, si d’autres mutations s’ajoutent, il faut s’inquiéter. Selon le professeur David Robertson, de l’université de Glasgow, le virus va générer des vaccins qui échapperont à de nouveaux mutants, ce qui signifie que les vaccins devront peut-être être mis à jour souvent. Les fabricants de vaccins étudient actuellement des rappels spécifiques à la souche ou des vaccins de prochaine génération qui pourraient cibler de multiples variantes dans un avenir proche [11]. Pour l’instant, les premières recherches montrent que les vaccins Pfizer-BioNTech et Moderna COVID-19 peuvent conférer une protection contre les variantes identifiées au Royaume-Uni et en Afrique du Sud [12] [13].

La science continue d’évoluer sur ces nouvelles variantes et il reste à comprendre l’étendue de leur propagation, la différence entre la maladie causée par ces nouvelles variantes et celle causée par d’autres souches de la maladie et la manière dont ces variantes peuvent affecter les thérapies, les nouveaux vaccins et les tests existants [14]. On s’attend à ce que de nouvelles variantes du virus continuent d’apparaître, la plupart viendront et iront même inaperçus, certains persisteront mais ne seront pas communs, certains augmenteront la population pendant un certain temps, puis disparaîtront [8].  Il peut également être difficile à ce stade de confirmer si certaines des mutations sont dues à des changements du virus ou à des modifications du comportement humain. En outre, il n’existe actuellement aucune preuve que ces nouvelles variantes provoquent une maladie ou une transmissibilité plus grave [15]. Alors que les recherches se poursuivent, l’Organisation mondiale de la santé (OMS) conseille aux autorités sanitaires nationales et locales de continuer à renforcer les activités existantes de lutte contre la maladie, notamment en surveillant étroitement leurs épidémies grâce à une surveillance et à des tests permanents, à la recherche des contacts et, le cas échéant, en continuant à adapter les mesures sanitaires pour réduire la propagation du virus et de ses variantes.

À l’exception de la variante de l’Afrique du Sud, la plupart de ces variantes n’ont pas encore été signalées en Afrique, mais cela pourrait être dû au fait que la surveillance systématique du séquençage n’est pas signalée dans tous les pays [1]. Néanmoins, l’OMS conseille aux pays de continuer à mettre en œuvre l’approche fondée sur le risque pour les voyageurs internationaux dans le cadre de COVID-19. Les nouvelles variantes n’appellent cependant pas de nouvelles mesures ou stratégies de prévention, nous devons continuer à respecter les mesures de barrière pour freiner la propagation de COVID-19. Il est également urgent d’intensifier les campagnes de vaccination actuelles car, plus le nombre de personnes infectées est élevé, plus les risques de mutations sont importants.

Les nouvelles variantes n’ont pas été signalées au Cameroun, mais il est nécessaire d’assurer une surveillance continue et, si possible, un séquençage systématique pour détecter ces variantes si elles se produisent. En attendant le déploiement complet du vaccin en Afrique et au Cameroun en général, il est important que les Camerounais prennent les mesures préventives plus au sérieux, signalent tout cas suspect et restent vigilants.

Références

  1. Organisation mondiale de la santé. Sept choses à savoir à propos des variants de la COVID-19 en Afrique OMS | Bureau régional pour l’Afrique n.d. https://www.afro.who.int/news/seven-things-know-about-covid-19-variants-africa (consulté le 17 février 2021).
  2. Centre national d’immunisation et des maladies respiratoires, Division des maladies virales (NCIRD) ( 2021). New Variants of the Virus that Causes COVID-19
  3. WHO 2020: Emergency preparedness and response. Variantes SARS-CoV-2
  4. Covid: La variante de l’Afrique du Sud est désormais “dominante” au Zimbabwe. BBC News 2021.
  5. Daniel C. DeSimone (2020); What’s the concern about the new COVID-19 variants? Are they more contagious?
  6. Weintraub K. “It’s like we’re trying our best to help the virus”: A fourth wave is looming if US fails to contain COVID-19 variants, experts say. USA TODAY n.d. https://www.usatoday.com/story/news/health/2021/02/16/covid-19-us-fourth-wave-variants-coronavirus/4460958001/ (consulté le 17 février 2021).
  7. Bloomberg JG|. Analysis | Why the Mutated Coronavirus Variants Are So Worrisome. Washington Post n.d.
  8. Stuart Ray and Robert Bollinger 2021; Nouvelles variantes de coronavirus, Ce que vous devez savoir
  9. Dois-je m’inquiéter des variantes du COVID-19? Les experts le décomposent. TODAYCom n.d. https://www.today.com/health/how-many-strains-covid-19-t207173 (consulté le 17 février 2021)
  10. James Gallagher 2020; Nouvelle variante de coronavirus: Que savons-nous?
  11. Andrew Joseph (2021); The good and the (potentially) bad: What scientists know about variants and Covid-19 vaccines
  12. Mayo Clinic. COVID-19 variants: What’s the concern? Mayo Clinic n.d. https://www.mayoclinic.org/diseases-conditions/coronavirus/expert-answers/covid-variant/faq-20505779 (consulté le 17 février 2021)
  13. Organisation mondiale de la santé. Episode #20 – COVID-19 – Variants & Vaccines n.d. https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/media-resources/science-in-5/episode-20—covid-19—variants-vaccines (consulté le 17 février 2021)
  14. COVID-19 linked with wider set of symptoms than previously thought – REACT study | Imperial News Imperial College London. Imperial News n.d. https://www.imperial.ac.uk/news/214693/covid-19-linked-with-wider-symptoms-than/ (consulté le 17 février 2021).
  15. Covid-19: New variant with potentially worrying mutations found in UK. The Irish Times n.d. https://www.irishtimes.com/news/world/uk/covid-19-new-variant-with-potentially-worrying-mutations-found-in-uk-1.4485832 (consulté le 17 février 2021)